Background
在定序技術中,特別是次世代定序(NGS),近年常被廣泛用在臨床應用,特別是非侵入性孕前檢測(Bianchi et al., 2015) 及癌症檢測。而序列樣品可能因為轉接子(Adapter)汙染、鹼基序列的誤差,或過度表現的片段造成分析的困難。更甚者,可能還會因為製備序列資料庫(Library)及定序過程的錯誤,造成不正確的核酸定序結果。因此,為了取得良好品質及高可信度的序列樣品以進行分析,序列品質控管及前處理為非常重要的一個環節。
Environment requirement
- Hardware: CPU : 2 cores
- RAM : 8 Gb
- Software :The pipeline is developed based on GA System. All software used in the pipeline are included in pre-defined software environments (GA application collection ). Please install suitable environment before start the pipeline(How to do it!) .
The diagram of workflow
GASystemChannel
-GA02 序列檔案品質分析 (coming soon)
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