黃彥華老師同時具有臨床醫學、分子生物實驗、及生物資訊學的專業背景,研究團隊專注於巨量生物醫學資料之分析,特別是新世代定序數據分析 (NGS)、轉譯體分析,以及跨領域之整合臨床研究及基礎研究之資料分析。於過去數年參與多項人類致病基因變異之發現,如SCA22, CMT,以及十多種新物種基因體轉譯體之註解工作,如靈芝、茭白筍黑穗病菌等等。
研究領域:
- 人類疾病之致病基因變異之尋找,新世代定序數據分析與整合解讀
- 新基因體 (如新的高毒性院內感染菌) 註解及比較基因體學
- 疾病/癌症相關之人類基因表現改變,及其調控網路分析
- 「臨床醫學研究」資訊系統、「防疫資訊系統」 (含院內感染菌鑑定、亞型之追蹤記錄、資料庫建置) 之開發與整合
學歷:
英國劍橋大學 桑格研究所 生物資訊博士
國立陽明大學 醫學士、生化碩士
經歷:
國立陽明大學生物醫學資訊所助理教授
國立陽明大學生物醫學資訊所助教
專長:
基因體、表現體定序數據分析
深度學習在定序定量數據分析之應用
深度學習與數位病理學
深度學習在生物醫學訊號分析之應用
證照:
中華民國考試院專門職業及技術人員高等考試醫師類科及格
研究成果:
- Huang, Y.H., Chou, S.H., Liang, S.W., Ni, C.E., Lin, Y.T.*, Huang, Y.W. and Yang, T.C. Emergence of an XDR and carbapenemase-producing hypervirulent Klebsiella pneumoniae strain in Taiwan. J Antimicrob Chemother. 73(8), 2039-2046. 2018. IF=5.758, Rank: 39/136, MICROBIOLOGY (本人為第一作者)
- Huang, Y.H., Su, T.C., Wang, C.H., Wong, S.L., Chien, Y.H., Wang, Y.T., Hwu, W.L., Lee, N.C.* RNA-seq of peripheral blood mononuclear cells of congenital generalized lipodystrophy type 2 patients. Scientific Data, 8(1):265. 2021. IF=8.501, Rank: 11/73, MULTIDISCIPLINARY SCIENCES (本人為第一作者)
- Chiu, Y.J., Ni, C.E., Huang, Y.H. (2023, May). Deconvolution of bulk gene expression profiles reveals the association between immune cell polarization and the prognosis of hepatocellular carcinoma patients. Cancer Medicine, (Accepted). (Accepted). (SCI, 90/360, Medicine – Oncology). nstc 109-2221-E-010-017-MY3. (本人為通訊作者)
- Ni, C.E., Doan, D.P., Chiu, Y.J., Huang, Y.H. (2022, Nov). TSSNet – A Deep Neural Network Model for Predicting Prokaryotic Transcription Start Sites. 2022 IEEE 22nd International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE), Taichung, Taiwan. (本人為通訊作者)