關於聯盟
設立宗旨
「臺灣基因體應用研發、技術及產業生態系聯盟」是國立陽明交通大學腫瘤與免疫學研究中心所營運的產業聯盟，成立的宗旨是透過中心研發的生物資訊及人工智慧的技術，串接國內基因體相關產業鏈，並擴大國內應用市場。本中心的前身是榮陽基因體中心，是全國最早成立也是唯一參加過人類基因體定序計畫的基因體中心，擁有20年基因體相關技術服務及研發的經驗。本聯盟的核心技術也來自中心，中心長期與國內產官學研單位有長期的合作，深刻了解目前國內基因體學發展的機會與困境。我們認為國內基因體學應用的外在環境已經漸趨成熟，但是核心問題是我們對基因體資訊的應用能力有限，以至於無法彰顯基因資訊的價值。如何讓使用者認知基因體序列的無限潛力，創造有感的服務體驗，是整個產業發展的核心問題。
聯盟希望藉由中心所發展的基因體分析者平台（Genomic Analyst Platform, GAP）及魔法卷軸封裝技術（Magic Scroll, MS）為核心技術，以基因體分析知識為主軸，串起臺灣基因體產業的研發及產品供應鏈，一直到終端應用。暢通從知識到商品的快速通道，量產各種應用商品，活絡臺灣基因應用市場。
核心技術
基因體分析者平台 Genomic Analyst Platform, GAP
基因體分析者平台（Genomic Analyst Platform, GAP）由國立陽明交通大學國家基因體學臨床及產業應用發展中心維護，是一個基於開源架構建立的生物資訊標準分析平台，可以進行多種生資分析，並且可以在個人電腦、工作站甚至超級電腦等不同規模的設備系統上運行。
GAP平台開發的方法、流程、判讀流程，又可以任何相容平台上重現。透過數據及分析方法的標準化，GAP平台促使生物資訊的研發成果迅速在開發單位與產業應用端流動，加速研發到商品的進程。
GAP平台已授權陽明立方公司開發出輕量型基因數據分析工作站「立方工作站」，在體積不到20x20x20立方公分設備中，執行基因體、轉錄體及單細胞定序分析任務，成為由GAP相容的邊緣計算設備，透過立方工作站，GAP平台已開始導入商業基因分析領域，應用於癌症基因研究、檢測及菌相分析上。
魔法卷軸封裝技術 Magic Scroll, MS
魔法卷軸封裝技術（Magic Scroll, MS）是一種軟體封裝技術，將GAP上支程式流程、判斷邏輯、基因註解及報告格式等，封裝在單一檔案中，便於在不同分析設備上重建。在實驗室發展出的應用分析流程，可以全部封裝成一個檔案（商品），而使用者購買下載後，就可立即在自己的設備中建立出一模一樣的分析流程。
此外，智慧財產的保護機制是建立知識經濟的基礎，MS成為應用知識交易的載具時，同時也考慮到智財保護，MS使用了高強度加密技術RSA-2048及AES-256保護卷軸內容，確保企業的營業祕密不會洩漏或在未授權的狀況下被使用，透過對卷軸加、解密管理，企業可以控制卷軸使用權限及次數，作為商業營利基礎。