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About sample preparation and quality check
1. 請問核心實驗室是否接受RNA 以外的樣品送件？
答：對不起，目前核心實驗室並沒有足夠的操作能量，可以接受RNA以外的樣品（例如冷凍組織及臘塊）。RNA抽取的方法及產量歧異性非常的大，核心實驗室並沒有一個可以適用於所有樣品的程序，可以確定得到最佳效果，我們認為，我們不會比申請人更了解樣品的特性，同時也沒有足夠的時間及人力針對每一個樣品去嘗試。所以在現階段的作業中，我們並不接受RNA以外的樣品。
2.如何判定RNA的品質是否合格？
答：請參閱 RNA品質分析。
3.血液中含有多少白血球?可抽出多少DNA, RNA,和 protein?
全血可分為血漿與血球兩部分，各佔血液的55%與45%。血球又可分為紅血球(RBC)、白血球(WBC)，與血小板，其所佔比例為500：1：30。血液中WBC的數量會隨年齡、性別等生理狀態而異，正常成人的WBC參考數值為4500 ~ 11000 / ml，2歲以前之孩童的WBC參考數值則為5000 ~ 13000 / ml。全血中所含有DNA含量為30~60 mg/ml blood (6 pg/cell)，RNA含量為1~5 mg/ml blood， plasma protein含量為60~80 mg/ml blood。DNA純化方式可利用QIAGEN之QIAamp DNA Blood Mini Kit，產量約為4~12 mg DNA / 200ml healthy whole blood，RNA純化方式可利用QIAGEN之QIAamp RNA Blood Mini Kit，產量約為1~5 mg RNA /ml healthy whole blood。
參考文獻
1. 何敏夫編著，血液學第三版，血液常規檢查，2002，p583-616
2. http://www1.qiagen.com/
4. 106 cells 可抽到多少 RNA?可做多少 cDNA?
106 cells 可抽到 10-35 μg total RNA，如:NIH/3T3可抽取到10μg total RNA，Hela可抽取到15μg total RNA，COS-7可抽取到35μg total RNA，LMH可抽取到12μg total RNA，Huh可抽取到15μg total RNA；至於可轉成多少 cDNA，得依基因在細胞中的表現情況而定，如 Abundant (如 GAPD、β-Actin)為100-1000copies/cell，Intermediate(如Translocation factors) 為10-100 copies，Rare(如TNF、M-CSF)為<10 copies/cell。以NIH/3T3為例106 cells可有 7*108-7*109 copies 的 G.APD、7*107-7*108 copies 的 translocation factors、7*106 copies 的 TNF。
About affymetrix genechip service
1.什麼是TEST Chip?
答：Test 是集合了許多物種的house keeping gene 的小型Chips，用途是在確認 RNA 的品質以及樣品處理時有無瑕玼。因為晶片成本很高，我們希望每一次都能有最好的結果，然而許多樣品或操作上的問題，必須要在實驗後掃描才會發現，然而那時已無法挽救了，因此，這時我們會建議先以成本較低的 Test chip 測試，若Test chip 結果正確，再進行正式實驗。本中心使用任何一種 Chip 時，皆可以額外申請 使用 test chip，僅需負擔 Chip 成本價格。
2.我知道我的RNA很爛，可是我非做不可！
答：有時樣品取得非常困難，而且品質上無法達到要求，這一點我們可以完全理解！這時我們會建議您跑一片 test chip，測試從樣品取得數據的可行性，再做決定。
3.我想作的Chip 沒有在服務的項目之中?
答：只要是eukaryotic expression 的Chip，我們都可以處理，我們也可以為您代訂，不過因為量少，所以在晶片成本上會高出很多，因此請連絡我們，我們會為您詢價，再告知可能的服務方法及價格。
About real-time quantitative PCR service
1.請問委託單位是如何定義?
由於本實驗室使用的是384well plate，因此有些實驗耗材及人工成本是以384反應為單位，亦即每一次不論1~384個反應均需使用一片封膜跟一個384well plate，所以理論上需以384個反應為一個計費單位(國家型計畫SYBR Green 應為NT$1080) 但考量到客戶的成本負擔，因此以192個反應為一個計費單位(國家型計畫SYBR Green 應為NT$540)；所以總反應數除以192尾數無條件進位至整數，即為委託單位。
舉例來說:
100個反應==委託單位為1
192個反應==委託單位為1
193個反應==委託單位為2
384個反應==委託單位為2
385個反應==委託單位為3
2.進行 Q-PCR 需要多少 RNA?
進行 Q-PCR 需要10-100ng RNA/reaction。
參考資料來源:
1.QIAGEN catalog-Rneasy Mini Handbook, OneStep RT-PCR Kit Handbook。